во время загрузки Windows выскакивает сообщение,нажать F11,И только после это...

Здравствуйте! Вероятнее всего у вас ноутбук, с предустановленным программным обеспечением. В таком случае при нажатии клавиши F11 запускается функция восстановления программного обеспечения ноутбука. По какой именно причине у вас происходит описанная ситуация сказать сложно. Можно предположить что после переустановки операционной системы данные из раздела recovery были отформатированы, но функция восстаноления "пытается запуститься" по умолчанию каждый раз когда вы загружаете операционную систему. Тем не менее это только предположение, объективно можно сказать только после проведения диагностики.